पूजा का जन्म 24 फरवरी 1972 को मुंबई, महाराष्ट्र में हुआ था. वो मशहूर फिल्म निर्माता महेश भट्ट की बेटी हैं. पूजा की मां लॉरेन महेश भट्ट की पहली पत्नी थीं. महेश भट्ट से उनके दो बच्चे पूजा भट्ट और राहुल भट्ट हैं. आलिया भट्ट उनकी सौतेली बहन हैं.
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पूजा भट्ट ने अपनी एक्टिंग की शुरुआत साल 1989 में फिल्म डैडी से की, जिसे उनके पिता महेश भट्ट ने डायरेक्ट किया था. पूजा उस वक्त महज 17 साल की थीं. इसके बाद उन्होंने दिल है कि मानता नहीं, सड़क और जख्म जैसी फिल्मों में काम किया. उन्होंने बॉलीवुड के फेमस एक्टर्स के साथ काम किया है, जिनमें संजय दत्त, आमिर खान और शाहरुख खान शामिल हैं. इसके बाद पूजा ने 1996 में अपनी प्रोडक्शन कंपनी 'पूजा भट्ट प्रोडक्शंस' लॉन्च किया. एक निर्देशक के रूप में उन्होंने हॉलिडे, धोखा, कजरारे, जिस्म 2 और पाप जैसी कई फिल्में बनाई.
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पूजा ने साल 2003 में मनीष मखीजा से शादी की थी. दोनों ने 11 साल बाद तलाक ले लिया था. पूजा के पति चैनल V के वीजे उधम सिंह के नाम से मशहूर हैं.
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तलाक के बाद पूजा भट्ट ने फिल्म 'जिस्म' प्रड्यूस की. इसके दौरान उनकी जिंदगी में एक्टर रणवीर शौरी (Ranvir Shorey) की एंट्री हुई. दोनों की रिश्ता भी कुछ खास नहीं चल सका. दोनों लिव-इन में रहे पर शराब के नशे में दोनों में मारपीट हुआ करती थी. बताया जाता है कि एक बार रणवीर शौरी ने शराब के नशे में पूजा की इतनी पिटाई की थी कि उनके खून तक निकल आया था. इसके बाद पूजा ने रणवीर के खिलाफ केस दर्ज करवा दिया था. हालांकि एक्टर का भी कहना था कि पूजा उनके साथ मारपीट करती हैं.
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महेश भट्ट ने अपनी बेटी पूजा भट्ट के साथ एक फिल्म मैगजीन के लिए बोल्ड फोटोशूट कराया था जिसमें उन्होंने पूजा को किस किया था. इस फोटो के पब्लिश होते ही बाप बेटी विवादो में घिर गए थे. फोटोशूट को लेकर मीडिया में इतना विवाद हुआ कि महेश को इसे खत्म करने के लिए प्रेस कॉन्फ्रेंस करनी पड़ी. हालांकि विवाद यहीं नहीं थमा. एक प्रेस कॉन्फ्रेंस में महेश भट्ट ने अपना दिल खोला और कहा, 'अगर पूजा मेरी बेटी नहीं होती, तो मैं उससे शादी कर लेता.' इसपर भी काफी बवाल हुआ था.